• 姓名: 彭友松
  • 职称: 副教授
  • 学位: 博士
  • 湖南大学
  • 生物学院
教育背景

2007年9月-2012年12月,中国科学院生物物理研究所,生物信息学专业,博士.导师,蒋太交教授;

2003年9月-2007年7月,山东大学生命科学学院,生物技术专业,学士。

工作经历

2016年3月至今,湖南大学生物学院助理教授,副教授;

2013年5月~2016年3月,湖南大学信息科学与工程学院计算机科学系助理研究员。

教授课程
数据统计与分析、生物信息学、生物信息学实验
学术成果

1 建立人流感H3N2病毒的抗原监测平台PREDAC-H3, 高致病性禽流感H5N1病毒的抗原变异预测平台PREDAC-H5以及通用型A型流感病毒抗原变异预测平台PREDAV-FluA。相关论文发表于《Bioinformatics》(2016),《Vaccine》(2014), 《Infection, Genetics and Evolution》(2014)与《Scientific Reports》(2017)

2 高致病性禽流感H5N1病毒的抗原进化研究

从该病毒的主要抗原蛋白的序列出发,通过发展计算模型对该病毒进行了系统的抗原分类,发现该病毒的抗原进化呈现分化式的进化模式,其流行具有明显的区域流行和多抗原类共流行的特点。这对于合理地制定疫苗政策提供一定的科学依据。相关论文发表于《Scientific Reports》(2017)

3禽流感H7N9病毒溯源

基于大量的禽流感基因组数据,成功地推导了中国2013年爆发的新型H7N9起源分子路径,发现了新型H7N9通过两次重配,分别经过野鸟和华东地区家禽两种宿主中进化产生。我国新型H7N9从哪里来问题的回答对如何防控禽流感提供了科学指导,在国际上引起广泛关注。相关论文发表于《Cell Host & Microbe》(2013)。

4 发展快速预测流感病毒危害性的方法

通过分析流感病毒在人群中导致的危害性与病毒发生的抗原变化,发现两者存在明显的正相关。基于该发现可以在流感病毒出现的早期快速地预测它造成的危害, 这对于流感病毒(特别是突发性流感大流行)防控政策的制定非常重要。相关论文发表于《PLoS Computational Biology》(2010)

5 流感病毒非编码序列研究

通过系统地分析和比较A型流感病毒所有亚型的HA和NA的非编码区,发现各HA和NA亚型在其非编码区上都具有亚型特异性的核苷酸,不仅序列有差异,而且长度也不同。后续的实验证明,这种序列和长度的差异影响到病毒的包装效率。相关论文发表于《Journal of Virology》(2014)。

6 新的位点共进化算法RCOS与用于计算位点共进化网络的R包cooccurNet

cooccurNet是目前已知的R语言中第一个用于共进化研究的包。该工作发表于《Bioinformatics》(2017)。

科研项目

1基于基因序列的高致病性禽流感H5N1病毒抗原进化计算研究,国家自然科学青年基金,2016年1月~2018年12月,23.6万,主持;

2 发展整合的方法系统地分析流感病毒基因复制的结构基础和分子机理,国家自然科学基金,2014年1月~2017年12月,24万,任务负责人;

3 季节性人流感病毒的疫苗推荐方法研究,湖南大学青年教师成长计划,2013年~2017年,20万,主持。

4 重大突发动物源性人兽共患病跨种感染与传播机制研究,国家重点研发计划,2016年~2020年,84万,任务负责人。

5 重要新发突发病原体发生与播散机制研究,国家重点研发计划,2016年~2018年,45万,任务负责人。

论文专著

1.Yuanqiang Zou, Yousong Peng, Lizong Deng and Taijiao Jiang*. Monitoring infectious diseases in the big data era. Science Bulletin, 2015, 10.1007/s11434-014-0696-5. (IF=1.6)

2.Jingfeng Wang, Yousong Peng, Lili Zhao, Mengmeng Cao, Tao Hung and Tao Deng*. Influenza A virus Utilizes a Suboptimal Kozak Sequence to Fine-tune Virus Replication and Host Response. J Gen Virol, 2014, 96: 756-66. (IF=3.2)

3.Chunfeng Li#, Aiping Wu#, Yousong Peng, Jingfeng Wang, Yang Guo, Zhigao Chen, Hong Zhang, Yongqiang Wang, Jiuhong Dong, Lulan Wang, F. Xiao-Feng Qin, Genhong Cheng, Tao Deng& Taijiao Jiang*. Integrating computational modeling and functional assays to decipher the structure-function relationship of influenza virus PB1 protein. Scientific Reports, 2014, 4. (IF=5.6)

4.Li Honglei#, Peng Yousong#*, Zou Yuanqiang, Huang Zechi, Wu Aiping, Li Kenli, Jiang Taijiao*, PREDAC-H5: A User-friendly Tool for the Automated Surveillance of Antigenic Variants for the HPAI H5N1 Virus. Infection, Genetics and Evolution, 2014, 28:62-63(IF=3.0)

5.Zou YuanQiang, Peng Yousong*, Lu Li, Deng Lizong, Jiang Taijiao*. Prediction of influenza epidemics at the province level in China using search query from Haosou[C]//Fuzzy Systems and Knowledge Discovery (FSKD), 2015 12th International Conference on. IEEE, 2015: 1450-1454.

6.Mi Liu#, Xiang Zhao#, Sha Hua#, Xiangjun Du, Yousong Peng, Xiyan Li, Yu Lan, Dayan Wang, Aiping Wu*, Yuelong Shu*, Taijiao Jiang*. Antigenic Patterns and Evolution of the Human Influenza A (H1N1) Virus[J]. Scientific reports, 2015, 5. (IF=5.6)

7.Lizong Deng#, Mi Liu#, Sha Hua#, Yousong Peng, Aiping Wu, F Xiao-Feng Qin, Genhong Cheng and Taijiao Jiang. Network of co-mutations in Ebola virus genome predicts the disease lethality[J]. Cell research, 2015, 25(6): 753. (IF=12.4)

8.Hua Sha, Li Xiyan, Liu Mi, Cheng Yanhui, Peng Yousong, Huang Weijuan, Tan Minju, Wei Hejiang, Guo Junfeng, Wang Dayan, Wu Aiping*, Shu Yuelong*, Jiang Taijiao*. Antigenic variation of the human influenza A (H3N2) virus during the 2014-2015 winter season. SCIENCE CHINA Life Sciences, 2015,58(9): 882-888. (IF=1.7)

9.Lili Zhao#, Yongsong Peng#, Kai Zhou#, Mengmeng Cao, Jing-feng Wang, Xue Wang, Taijiao Jiang, and Tao Deng*. New insights into the non-conserved non-coding region of the subtype-determinant HA and NA segments of influenza A viruses. J Virol. 2014 Oct;88(19):11493-503. doi: 10.1128 (IF=4.4)

10.Yousong Peng#, Yuanqiang Zou#, Honglei Li, Kenli Li, Taijiao Jiang*. Inferring the antigenic epitopes for highly pathogenic avian influenza H5N1 viruses. Vaccine, 2014, 32(6):671-6 (IF=3.6)

11.Aiping Wu#, Chunhu Su#, Dayan Wang#, Yousong Peng#, Mi Liu, Sha Hua, Tianxian Li, George F. Gao, Hong Tang, Jianzhu Chen, Xiufan Liu, Yuelong Shu, Daxin Peng, and Taijiao Jiang*. Sequential Reassortments Underlie Diverse Influenza H7N9 Genotypes in China. Cell Host & Microbe, 2013, 14(4):446-52. (IF=12.3)

12.Xiangjun Du#, Libo Dong#, Yu Lan, Yousong Peng, Aiping Wu, Ye Zhang, Weijuan Huang, Dayan Wang, Min Wang, Yuanji Guo, Yuelong Shu* & Taijiao Jiang*. Mapping of H3N2 influenza antigenic evolution in China reveals a strategy for vaccine strain recommendation. Nature communications, 2012, 3:709 (IF=11.5)

13.Aiping Wu#, Yousong Peng#, Xiangjun Du, Yuelong Shu, Taijiao Jiang* (2010). Correlation of Influenza Virus Excess Mortality with Antigenic Variation: Application to Rapid Estimation of Influenza Mortality Burden. PLoS Comput Biol 6(8): e1000882. doi:10.1371/journal.pcbi.1000882 (IF=4.6)

14.Yuanqiang Zou, Zhiqiang Wu, Lizong Deng, Aiping Wu, Fan Wu, Kenli Li, Taijiao Jiang*, Yousong Peng*; cooccurNet: an R package for co-occurrence network construction and analysis. Bioinformatics 2017 btx062. doi: 10.1093/bioinformatics/btx062

15.Yousong Peng#, Xiaodan Li#, Hongbo Zhou, Aiping Wu, Libo Dong, Ye Zhang, Rongbao Gao, Hong Bo, Lei Yang, Dayan Wang, Xian Lin, Meilin Jin*, Yuelong Shu*, Taijiao Jiang*. Antigenic Diversification of Avian Influenza H5N1 Viruses in China. Scientific Reports, 2017, 7:43566, DOI: 10.1038/srep43566

16.Yousong Peng*, Dayan Wang, Jianhong Wang, Kenli Li, Zhongyang Tan, Yuelong Shu, Taijiao Jiang*. A universal computational model for predicting antigenic variants of influenza A virus based on conserved antigenic structures. Scientific Reports, 2017, 7:42051 | DOI: 10.1038/srep42051

17.Yousong Peng, Dayan Wang, Yuelong Shu, Taijiao Jiang. Large discrepancy between the two-way rNHT distances in hemagglutinin-inhibition assay[J]. Virologica Sinica, 2016: 1-3.

18.Youson Peng#, Lei Yang#, Honglei Li, Yuanqiang Zou, Lizong Deng, Aiping Wu, Xiangjun Du, Dayan Wang, Yuelong Shu*, Taijiao Jiang*. PREDAC-H3: A user-friendly platform for antigenic surveillance of human influenza A(H3N2) virus based on hemagglutinin sequence. Bioinformatics 2016 32: 2526-2527.